Single cell Chromium X

Isolement de cellules uniques pour l’analyse de l’expression des gènes en séquençage NGS (10X Genomics)

Cette technologie permet de capturer de 500 à 10000 cellules/échantillon frais, fixés ou FFPE et d’analyser leur expression génique individuelle.

Cette approche permet de rendre compte de l’hétérogénéité cellulaire. Afin de mieux identifier les sous-populations cellulaires ou de suivre l’expression d’une protéine de surface d’intérêt, il est également possible de coupler la mesure d’expression génique individuelle à l’identification de protéines de surface cellulaire par la méthode CITE-Seq (marquage par anticorps/antigène couplé à un acide nucléique).

Le principe de la technologie repose sur l’encapsulation d’une cellule dans une gouttelette et l’identification de ses acides nucléiques par un code-barre spécifique individuel.

D’autres applications sont disponibles : VDJ, ATAC-seq, Multiome (Expression + ATAC-seq), CRISPR screening…

L’accès à cette technologie se fait par prestation de projet et devis spécifique.