APPAREILS
– gÉNomique
& TRANSCRIPTOMIQUE
Single cell Chromium X
Isolement de cellules uniques pour l’analyse de l’expression des gènes en séquençage NGS (10X Genomics)
Cette technologie permet de capturer de 500 à 10000 cellules/échantillon frais, fixés ou FFPE et d’analyser leur expression génique individuelle.
Cette approche permet de rendre compte de l’hétérogénéité cellulaire. Afin de mieux identifier les sous-populations cellulaires ou de suivre l’expression d’une protéine de surface d’intérêt, il est également possible de coupler la mesure d’expression génique individuelle à l’identification de protéines de surface cellulaire par la méthode CITE-Seq (marquage par anticorps/antigène couplé à un acide nucléique).
Le principe de la technologie repose sur l’encapsulation d’une cellule dans une gouttelette et l’identification de ses acides nucléiques par un code-barre spécifique individuel.
D’autres applications sont disponibles : VDJ, ATAC-seq, Multiome (Expression + ATAC-seq), CRISPR screening…
L’accès à cette technologie se fait par prestation de projet et devis spécifique.
Centre de Recherches contre le Cancer de Toulouse (Oncopole)
Toulouse - FR
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