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Diversity in rRNA 2’Ome profiles in cancer and impact on translational regulation

Conférence de Virginie Marcel, Centre de recherche en cancérologie de  Lyon, UMR INSERM 1052 CNRS 5286, Centre Léon Bérard, Université Lyon 1, Nuclear domains and pathologies team, Lyon, France

Visioconférence donnée le mardi 10 mai 2022 dans le cadre des séminaires de l’axe 2 “ARN et Cancer” du CRCT

Alors que le ribosome a été considéré pendant plus de 40 ans comme un acteur neutre de l’expression des gènes, il apparaît désormais comme un régulateur clé de la traduction par la modulation de sa composition, notamment via des modifications chimiques des ARN ribosomiques (ARNr). Dans des modèles cellulaires, nous avons révélé que la ribose 2′-Ométhylation (2’Ome) des ARNr peut être modulée chez l’homme et devenir une source de diversité des ribosomes. Nous avons signalé que la 2’Ome est modifiée au cours de la tumorigenèse et qu’elle affecte directement le comportement traductionnel des ribosomes vers des sous-ensembles d’ARNm. Cependant, il restait à démontrer si l’altération de l’ARNr 2’Ome se produit dans la ” vraie vie “. Grâce à une technologie omique innovante, la RiboMETH-seq, nous avons démontré pour la première fois que l’ARNr 2’Ome est altéré dans différents types de cancer, notamment le cancer du sein et le gliome. Il semble que la variabilité du niveau de l’ARNr 2’Ome soit limitée à un sous-ensemble de positions. De plus, la comparaison de plusieurs tumeurs adultes indique que la plupart de ces sites variables sont communs à différents sites tumoraux alors que peu d’entre eux sont spécifiques à un type de cancer particulier. Nos données soutiennent l’entrée récente du ribosome dans le domaine émergent de l’épitranscriptomique.

Référence

(1) Marcel et al. (2013) Cancer Cell 24, 318-330.

(2) Erales et al. (2017) PNAS 114, 12934-12939.

(3) Marcel et al. (2020) NAR Cancer 2, 318.

(4) Jaafar et al. (2021) Cells 10, 1948.

Vidéoconférence