Atlas des organelles du cancer du sein : combinaison d’ESPRESSO et de la protéomique spatiale pour étudier l’hétérogénéité des tumeurs

Lorenzo Scipioni & Giulia Tedeschi

Le cancer du sein est une maladie très hétérogène, composée de nombreuses sous-populations qui diffèrent par leur profil métabolique, leur potentiel métastatique, leur résistance aux thérapies et leur capacité à initier des tumeurs. Pour étudier cette hétérogénéité et la transition possible entre ces phénotypes, nous couplons le phénotypage ESPRESSO à la protéomique spatiale hautement multiplexée, générant des ensembles de données reliant les propriétés des organites à l’expression des protéines dans les cellules 2D et les sphéroïdes 3D. Nous surveillons l’expression des protéines liées à la glycolyse, à la phosophorylation oxydative, à la prolifération, au métabolisme des lipides, à la migration, à la résistance aux médicaments, à l’organisation chromatique et à la classification du cancer du sein, afin d’élucider le rôle biologique des propriétés des organites. Cette approche multiomique spatio-temporelle unique nous permet d’identifier la signature de l’expression des organites et des protéines, leur évolution temporelle et leur implication dans la chimiorésistance et la rechute.

 Illustration :

Cellules de cancer du sein triple négatif (MDA-MB-231) marquées avec sept colorants fluorescents ciblant l’ADN, les mitochondries, les lysosomes, les endosomes, les gouttelettes lipidiques, l’appareil de Golgi et la tubuline, imagées en microscopie confocale hyperspectrale.