APPAREILS
– gÉNomique
& TRANSCRIPTOMIQUE
novaseq 6000
S’appuyant sur la technologie de séquençage nouvelle génération (NGS), divers types de Flow Cell, deux flux de travail pour le chargement des librairies et diverses combinaisons de longueurs de lecture, le système NovaSeq 6000 permet d’ajuster efficacement le débit pour mieux répondre aux besoins des utilisateurs.
Le NovaSeq 6000 permet un rendement pouvant atteindre 6 Tb et 20 milliards de lectures en moins de deux jours.
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Rendements et temps de run par Flow Cell |
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|
Flow Cell |
SP |
S1 |
S2 |
S4 |
|
Lignes |
2 |
2 |
2 |
4 |
|
output |
65-400Gb |
134-500 Gb |
333-1250Gb |
280-3000Gb |
|
Single reads |
650-800M |
1.3-1.6 B |
3.3-4.1B |
8-10B |
(Source : Illumina)
|
Recommandation de séquençage/nombre d’échantillons par Flow Cell |
|||||
|
Application |
Résultats attendus |
SP |
S1 |
S2 |
S4 |
|
Génome humain |
<120Gb de données par échantillon pour une couverture 30X du génome |
2 |
4 |
10 |
24 |
|
Exomes |
>8Gb de données par échantillon pour une couverture 100X du génome |
20 |
40 |
100 |
250 |
|
Transcriptomes |
≥50M reads |
16 |
32 |
82 |
200 |
(Source : Illumina)
Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (Oncopole)
Toulouse – FR
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Compte officiel du Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse
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🇬🇧Cytidine deaminase-dependent mitochondrial biogenesis as a potential vulnerability in pancreatic cancer cells. ImPact team @CordelierPierre article from @crctoncopole published in @CommsBio
➡️https://www.crct-inserm.fr/en/targeting-the-energy-production-process-in-pancreatic-cancer-cells-which-relies-on-an-enzyme-called-cytidine-deaminase-could-make-these-cells-more-vulnerable/
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